本館には、東京大学大学院理学系研究科に属する研究室があり、植物分類学・系統学などの植物の進化多様性の研究の研究が行われています。また、東京大学植物標本庫、図書室があり、所蔵している約80万点の植物標本、図書は国内外の多くの研究者によって利用されています。

（関係者以外は、立入禁止）